La Quinta temporada de Merlin comenzó el 6 de Octubre de 2012 y finalizó el 24 de Diciembre de 2012 con un total de 13 episodios.
Episodio 1
Dado que las fuerzas del destino proyectan una sombra sobre Camelot, Merlín debe confrontar sus más oscuros temores.
Episodio 2
Las antiguas profecías de Mordred, pesan mucho sobre Merlín.
Episodio 3
Arthur pone en riesgo todo cuando convoca a un espíritu de entre los muertos, Uther.
Episodio 4
Morgana conjura una decepción tan poderosa que afecta a todo Camelot.
Episodio 5
Cuando Arthur hace enoja al antiguo Disir, Merlín debe tomar la decisión más difícil de su vida.
Episodio 6
Morgana usa a Gwen para seducir a Arthur a una trampa mortal, al encarcelarla en la Torre Oscura.
Episodio 7
El rey Arthur es el objetivo de un peligroso asesino, así como su esposa la reina Guinevere.
Episodio 8
Una red mortal se cierra en torno a Arthur, Merlín está lejos de Camelot.
Episodio 9
Merlín arriesga todo para ponerle fin al control de Morgana sobre Gwen.
Episodio 10
Morgana encabeza una aterradora cacería humana, persiguiendo a su antiguo enemigo Alathor de Catha.
Episodio 11
Un afligido Mordred debe elegir entre el amor y la lealtad.
Episodio 12
Merlín se encuentra enfrentando el futuro que ha tratado de evitar por tanto tiempo.
Episodio 13
Conforme se agudiza la batalla en la vasta llanura, Merlín se enfrenta a su destino.
