La segunda temporada de Star Trek: Voyager comenzó el 28 de Agosto de 1995 y finalizó el 20 de Mayo de 1996 con un total de 26 episodios.
Episodio 1
La Voyager aterriza en un planeta abandonado en el que descubre a un grupo de humanos que fueron abducidos en la Tierra en el año 1937 y que están en estasis temporal, incluyendo a la perdida Amelia Earhart.
Episodio 2
Un joven Kazon fracasa en su intento de ganarse un nombre como guerrero matando a Chakotay, a quien le ofrecen la libertad a cambio de matar al joven.
Episodio 3
El Doctor es incapaz de distinguir entre realidad y fantasía después de haber sufrido un accidente, sobre todo cuando se encuentra al teniente Reginald Barclay, que aconseja al Doctor que se salve destruyendo la Voyager.
Episodio 4
Unos alienígenas interfieren en el desarrollo de Kes provocando el elogio, el único momento fértil de la vida de un Ocampa. Si desea tener un hijo, este será el momento.
Episodio 5
Harry Kim despierta en San Francisco (en la Tierra del siglo XXIV) y sus amigos no se sorpenden de verle allí. La confusión es mayor cuando los archivos de la Flota Estelar confirman que nunca formó parte de la ...
Episodio 6
Una onda distorsionadora afecta a la Voyager provocando graves desperfectos y ejerciendo una fuerza que un poco tiempo destruirá la nave.
Episodio 7
Neelix y Tom Paris luchan por Kes, pero son enviados en una misión lejana juntos.
Episodio 8
Janeway tiene visiones de su holoprograma después de haber abandonado la sala de hologramas. La preocupación aumenta cuando se descubre que a otros miembros de la tripulación les está ocurriendo lo mismo.
Episodio 9
Chakotay descubre en un planeta desconocido un signo que identifica como algo perteneciente a su adolescencia en la Tierra.
Episodio 10
La Voyager encuentra una estación espacial ocupada por Ocampas. La sorpresa es enorme cuando descubren que existe la posibilidad de volver a la Tierra.
Episodio 11
La Voyager es atraída a una trampa al seguir una señal que en teoría procede de la Federación. Pronto descubren que la malvada Seska se ha unido a los Kazon y que tiene una sorpresa reservada ...
Episodio 12
Durante una misión, Tuvok y B'Elanna son secuestrados por soldados Mokra. Durante el rescate, Janeway contacta con un hombre que piensa que ella es su hija.
Episodio 13
B'Elanna Torres consigue reactivar un robot que ha encontrado perdido por el espacio. Pronto descubre que tiene la capacidad de crear otros robots semejantes a él y la situación empieza a descontrolarse.
Episodio 14
Janeway inicia una alianza con alguna secta de los Kazon. Durante el transcurso de las negociaciones se descubrirá a un traidor dentro de la tripulación.
Episodio 15
Tom Paris consigue llevar una lanzadera a una velocidad superior al Warp 10. Sin embargo, la experiencia tiene como consecuencia unos efectos secundarios que provocan un grave deterioro físico del piloto.
Episodio 16
Un asesinato sin sentido se produce a bordo de la Voyager. Tuvok intenta comprender, mediante una fusión mental, que movió al asesino a cometer este acto. La experiencia provoca que el pacífico vulcaniano se vuelva inexplicablemente violento.
Episodio 17
Inexplicablemente la Voyager encuentra un arma de destrucción masiva cardasiana en pleno cuadrante Delta. B'Elanna Torres tendrá que trabajar contra reloj para evitar que el arma alcance un objetivo que provocaría millones de muertes.
Episodio 18
La tripulación descubre un miembro del Continuum Q a bordo que quiere suicidarse y que acaba implicando a Janeway en un extraño proceso judicial.
Episodio 19
El Doctor se siente atraído por una mujer Vidiiana durante un tratamiento. Sin embargo, sabe que la mejoría experimentada durante el tratamiento puede ser temporal.
Episodio 20
Neelix descubre que Tom Paris tiene intención de abandonar la nave. Durante su investigación descubrirá quien es el espía de los Kazon Nistrim que se encuentra entre la tripulación.
Episodio 21
Un extraño fenómeno provoca que la USS Voyager y toda su tripulación sean duplicadas. Durante un ataque de los Vidiianos no quedará más remedio que sacrificar a una de las dos naves.
Episodio 22
Al estrellarse en un planeta, Tuvok descubre a tres niños que han sido abandonados allí por su raza. Pronto confirmará que existen motivos para hacer tan cruel acto.
Episodio 23
Intentando reanimar a unos colonos que se encuentran en estado de hibernación, Harry Kim y B'Elanna Torres se conectarán a la máquina que los mantiene en vida y se verán inmersos en una especie de realidad ...
Episodio 24
Un accidente en el transportador fusiona a Tuvok y a Neelix creando un nuevo ser. Es posible recuperar a los dos miembros de la tripulación, pero a costa de sacrificar al nuevo ser surgido de la fusión.
Episodio 25
Janeway y Chakotay son infectados por un insecto portador de una enfermedad cuyos síntomas sólo son bloqueados por el medio ambiente de un planeta en el que se verán condenados a permanecer de por vida.
Episodio 26
Seska y los Kazon Nistrim toman el control de la Voyager y abandona la tripulación en un planeta primitivo.
